La Emperatriz debe su nombre a la antigua propietaria de la finca en el s. XIX, Eugenia de Montijo.

Eugenia de Montijo estuvo casada con el emperador Napoleón III –quien clasificó la zona de Burdeos en Crus- y fue, por tanto, emperatriz de Francia.

Bajo su auspicio se cultivó la viña en la finca de Baños de Rioja. Ya en esa época, los vinos elaborados en la propiedad merecieron distinciones por su calidad. La bodega conserva aún los títulos que lo acreditan (Haro, 1878; París 1894).